El programa de Doctorado en Nanociencias fue autorizado por la Junta Directiva del Cinvestav, en julio de 2009, con la finalidad de formar de recursos humanos altamente capacitados para la investigación en temas de ingeniería, ciencias básicas y biotecnología orientados y enfocados a cubrir las demandas, necesidades de las industrias y la sociedad mexicana en las áreas de las Nanociencia y Nanotecnología (NyN).
Su Colegio de Profesores está conformado por 40 investigadores adscritos a distintos departamentos quienes forman el núcleo académico básico que trabajan y poseen proyectos de investigación en campos a fines a las NyN, y tienen publicaciones internacionales de alto nivel, todos son miembros del SNII.