Inmunopatología de la esclerosis múltiple, en donde colabora con el Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía, la Fundación Japonesa para la Investigación en Cáncer y la Universidad de Tokio. 
Desarrollo de modelos tridimensionales humanos para el estudio de enfermedades infecciosas intestinales, en colaboración con el Centro Médico Nacional Siglo XXI y el Instituto Max Planck para la Biología Infecciosa.

Biología molecular de los factores de virulencia de Entamoeba histolytica.
Biología molecular y genética de la multirresistencia a fármacos en E. histolytica.
Organización del genoma amibiano.