El Laboratorio de Microscopía es una de las áreas de servicios especializados con las que cuenta el Cinvestav Irapuato y cuyo objetivo es proveer de servicios de diagnóstico e inspección visual a la comunidad científica y empresarial de todo el país, a través de los más avanzados equipos de microscopia electrónica y fotónica. Los campos de atención comprenden desde las ciencias biológicas hasta las ciencias de los materiales. Sin embargo, debido a las restricciones en materia de bioseguridad se excluye las muestras humanas y de diagnóstico veterinario. Nuestro compromiso es brindar un servicio adaptable a las necesidades del quehacer científico y por otra parte al diagnóstico industrial. Además, uno de nuestros objetivos es acompañar a nuestros clientes desde el proceso de planeación de sus proyectos hasta la interpretación de los resultados, brindándoles continuo apoyo para alcanzar sus metas.