Unidad Irapuato
- Algoritmos para la reconstrucción de historias evolutivas de familias de genes.
- Machine learning y deep learning para la clasificación taxonómica en metagenomas, entre otros problemas biológicos.
- Construcción y análisis de redes para el estudio de interacciones microbianas, planta-patógeno, co-expresión y corregulación de genes.
Unidad Irapuato
- ADN inmunogénico y pro-inflammatorio en plantas y humanos
- Mutualismos defensivos y de nutrición entre plantas , insectos y microorganismos (mutualismos defensivos y de nutrición).
- DAMPs (patrones moleculares asociados a daño) y compuestos orgánicos volátiles (COVs) como vacunas para plantas.
Unidad Irapuato
- Identificación de mecanismos de duplicación y neofuncionalización de genes en plantas.
- Participación de ubicuitín-ligasas del tipo ATL en respuestas al estrés en Arabidopsis thaliana.
- Análisis a nivel molecular de las respuestas tempranas e inmediatas al estrés hídrico en Arabidopsis thaliana.
Unidad Irapuato
- Evolución bajo domesticación de cultivos mesoamericanos
- Efectos de la domesticación sobre los genomas
- Genómica de poblaciones, diversidad genética y conservación de cultivos nativos
Unidad Irapuato
- La transducción de señales en la membrana plasmática de células vegetales.
- Las proteínas de membrana de plantas en las respuestas al estrés abiótico
- Análisis de proteínas de membrana por espectrometría de masas.